ユーザーミーティングでの講演のうち2つを公開しました。1つ目はシングルセルプロテオミクスにおけるMascot ServerとMascot Distillerの適切な設定についての話です。2つ目はマトリックス・サイエンスの設立から25年の歴史について、12枚のスライドに凝縮して紹介しています。

Single cell proteomics with Mascot(PDF) – Patrick Emery, Matrix Science

• SCoPE-MS(訳者注:キャリアプロテオームなどを使った質量分析ベースのプロテオミクス)のスペクトルはバルクサンプルのスペクトルと類似しており、Mascotの標準的な設定で問題なく使用できます。
• キャリアプロテオームなどを使用しないシングルセルのスペクトルは、バルクのスペクトルとは全く異なりS/Nが低いです。設定値にも注意が必要です。
• 適切なピークピッキングを行う事でMascotは良い結果を得ることができます。また、Percolator機能を有効にすることをお勧めします。

25 years of Matrix Science(PDF) – Ville Koskinen, Matrix Science

• 1998年： John Cottrell とDavid Creasyがマトリックス・サイエンス社を設立。
• 1999年：「Mascot Server 1.0」がリリースされ、無料サービスを開始
• 2019年：オンラインサーバーでのMascot検索数が2,500万件を突破

また当社ホームページでもその内容についてご紹介しています。

ASMS 2023で発表されたポスターの中から、Mascotの有用性を紹介する5つのポスターを厳選してご紹介します。 ASMSで発表されたMascotを使った作品の中で、次回のニューズレターに掲載したいものがありましたら、PDFまたはURLをお送りください。

TP 370: The Challenge of Plant Identification in Complex Mixtures: Closely Related Families, Large Proteomes, and Unsequenced Genomes (PDF abstract)
Melinda A. McFarland¹; Sara M. Handy¹; Elizabeth Hunter¹; Christine H. Parker¹; Ann M. Knolhoff^1
1FDA-CFSAN, College Park, MD

MP 009: Collagen Remains in Palaeotherium Bone from the Isle of Wight (UK) (PDF abstract)
Joseph Hubbard¹; Steven Robinson²; Ardern Hulme-Beaman³; Martin Munt⁴; Krzysztof Pawlak²; Steve Taylor^1
1Department of Electrical Engineering & Electronics, University of Liverpool; ²Materials Innovation Factory, University of Liverpool; ³University of Liverpool, Liverpool, United Kingdom; ⁴Dinosaur Isle Museum, Sandown, United Kingdom

MP 600: Inside into the proteome of Chelidonium majus latex (PDF abstract)
Joanna Gracz-Bernaciak¹; Oliwia Mazur¹; Natalia Kielich¹; Michalina Krakowiak¹; Sophia Bałdysz¹; Martyna Węglewska¹; Oskar Musidlak¹; Agata Malinowska²; Robert Nawrot^1
1Adam Mickiewicz University in Poznan, Faculty of Biology, Department of Molecular Virology, Poznan, Poland; ²Polish Academy of Sciences, Institute of Biochemistry and Biophysics, Mass Spectrometry Laboratory, Warsaw, Poland

MP 734: Quantitative spatial proteomics combined with lipidomic analysis of human hippocampus using laser capture microdissected cells from MALDI-imaged tissue sections (PDF abstract)
Lauren R. DeVine¹; Caitlin M. Tressler¹; Rahul A. Bharadwaj²; Kristine Glunde¹; Daniel Weinberger²; Robert N. Cole^1
1Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, MD; ²Lieber Institute for Brain Development, Baltimore, MD

TP 575: Automated Data Analysis Workflow Leveraging PASEF Data Accelerates Confident Detection of Low-Abundance HCPs (PDF abstract)
Amy Claydon¹; Guillaume Tremintin²; Juergen Kastler³; Stuart Pengelley⁴; Jonathan Krieger²; Arnd Brandenburg^3
1Genedata Ltd., Cambridge, United Kingdom; ²Bruker, San Jose, CA; ³Genedata AG, Basel, Switzerland; ⁴Bruker Daltonics, Bremen, Germany

この度、Mascotのトレーニングページを更新しました。スペクトルライブラリ検索とクロスリンクの2つのモジュールが追加され、すべてのスクリーンショット・スライドを見直しました。このコンテンツの対応バージョンはMascot Server 2.7およびDistiller 2.7です。バージョン2.8の内容への対応は近日中に行われる予定です。トレーニングコースの教材は無料で提供されており、自己学習や社内トレーニングコースの基礎として最適です。