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DDA プロテオーム解析において、関連ソフトウェアの解析結果を取り込んで、データ横断的な同定・定量解析を行うソフトウェアです

主な機能

Mascot, Scaffold 5, MaxQuant, Proteome Discoverer をはじめ各種検索エンジンや解析ソフトウェアのタンパク質同定/定量結果ファイルを取り込み、データ横断的に解析
MSFragger との対応によりRaw データから解析を開始する事が可能
“Experimental Design Wizard” : 各サンプルの関係性を定義するとともに、適した統計解析手法を案内
Gene Ontology 対応 : タンパク質の役割・生化学的な機能・発現位置を表す情報の表示
定量値を使った統計解析・グラフ表示
XLSをはじめとする様々なフォーマットで結果内容を出力
無償 Viewer ソフトウェア : 使いやすいGUIを誰でも利用可能

Mascot Server, Mascot Distiller, MaxQuant, Proteome Discoverer, MSFragger, FragPipe など
Scaffold 5/Q+S などProteome Software社旧プログラムの解析ファイル (sf3)
mzIdentML（上記以外の検索エンジンの結果についても取り込みが可能）