MASCOT など各種検索エンジンの検索結果を取り込み、結果をサンプル毎にまとめて表示したり結果の検証に役立つアルゴリズムを適用したり、様々な生物学的情報の表示を行うソフトウェアです。
主な機能
- MASCOT など各種検索エンジンの結果を取り込み、サンプル間比較の表を作成
- 内部搭載している X!Tandem でデータ取り込み時に追加の検索が実施可能
- データ取り込みのバッチ処理 new！
- データ取り込み時に独自の同定結果検証アルゴリズムを適用
- 表示するタンパク質・ペプチドの基準をインタラクティブに変更可能
- 同定タンパク質-同定ペプチドの関係性の確認やスペクトルデータの検証が容易
- ベン図を使ってサンプル間共通/サンプル独自のタンパク質・ペプチドをリストアップ
- Gene Ontology 情報付与・表示
- Pathway データベースへのリンク
- 複数の Spectral Counting に対応。Precursor Intensity を利用した定量手法にも一部対応
- 論文の method 記述サポートと repository サイト投稿補助
- XLS フォーマットで結果内容を出力
- 無償 Viewer ソフトウェアを使って結果のシェアが容易に
- Scaffold Q+S[オプション]により、定量解析結果の取り込みと表示が可能となります
検索エンジンの結果取り込みとサンプル間の比較表作成 / Gene Ontology 情報付与・表示
表示するタンパク質・ペプチドの基準をインタラクティブに変更可能
Pathwayデータベースへのリンク
スペクトルデータの検証
ベン図を使ってサンプル間共通/サンプル独自のタンパク質・ペプチドをリストアップ
サポートする入力データ
- MASCOT
- Proteome Discoverer
- MaxQuant
- PLGS-Identity
- その他 mzIdentML で出力した検索エンジンの結果（PEAKS，Protein Pilot など）
インストールするコンピュータの推奨スペック
- OS：Mac（OS 10.9以降），Windows 10，Linux（Ubunts 12以降，centOS 5.6以降）
- メモリ：32GB以上
- ディスク：SSD（HDDとあわせて1TB以上）