signboard of Scaffold-LFQ

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Scaffold や各種検索エンジンの解析結果を取り込み、データ横断的な同定タンパク質の比較と定量解析を行うソフトウェアです。


主な機能

  • Scaffold や各種検索エンジンの結果ファイルを取り込み、大量データを一度に表示
  • Sequence coverage のサンプル別比較
  • Gene Ontology 情報付与・表示
  • 各実験の関係性を定義するとともに適した解析手法を案内する “Experimental Design Wizard”
  • 各種定量値 (spectral counting , precursor intensity) を使った統計解析とグラフ表示
  • XLS フォーマットで結果内容を出力
  • 無償 Viewer ソフトウェアを使って結果のシェアが容易に

Scaffoldや各種検索エンジンの結果ファイルを取り込み、大量データを一度に表示




Sequence Coverage サンプル別比較




Experimental Design Wizard




Gene Ontology に関する情報の表示




統計解析とグラフ表示




インストールするコンピュータの推奨スペック

  • OS:Mac(OS 10.9以降),Windows 10,Linux(Ubunts 12以降,centOS 5.6以降)
  • メモリ:64GB以上
  • ディスク:SSD(HDDとあわせて1TB以上)